激光打標加工技術應用，在醫療行業也是顯而易見的。醫療設備進行激光打標加工的應用是很多的，在不銹鋼外科手術和牙科設備上打標，這些標記更易讀取，甚至經受消毒的次數可以增加百倍。

最重要的是，它是在絕對光滑面上打標，可以防止細菌粘著在表面。經過激光打標加工的表面不能損害耐腐蝕的化學鈍化處理，才能讓防腐涂層即使經過數年的使用以及無數次的清洗和消毒，也一直存在。

 激光打標加工因為它確保了標記的高質量和高精密度，保證系統的可靠性以及極佳的重復精度。醫療領域的制造商們必定要嚴格遵守既定的工藝流程。

  制造商們如擁有在視覺系統的幫助下可以重復精度的設備，則處于一個有利的位置。一些供應商已經提供配備集成視覺系統的打標機器，能夠檢測出組件位置的變化，檢測出有瑕疵的零件，并自動調整相關的打標。這樣就不再需要或極少需要制造商對標識工作進行調整。激光打標加工技術在醫療行業發揮著重要作用。